53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1353 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1353  peptidase  100 
 
 		 114 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  51.46 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  50.52 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  47.22 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  47.22 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  45.37 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  50 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  55 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  52.94 
 
 		 104 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  58.02 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  44.21 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  42.72 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  41.41 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  39.39 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  39.39 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  53.12 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  53.12 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  37.76 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  38.14 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  41.46 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  31.25 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  45.71 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  46.58 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  36.59 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  36.59 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  43.55 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  35.37 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  31.17 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  37.31 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.81 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  34.21 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  37.31 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  37.31 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  30.26 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  33.33 
 
 		 101 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  37.31 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  29.87 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  32.05 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  31.4 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  30.49 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3687  peptidase  38.98 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.075913  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  36.51 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  26.04 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  29.58 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  32.39 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  34.25 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  25.51 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3019  peptidase  40 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0422  propeptide PepSY amd peptidase M4  39.68 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>