More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0982 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 384 aa  786    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  39.68 
 
 		 382 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  36.6 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  34.82 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  34.73 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  31.28 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  32.59 
 
 		 383 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  33.53 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  33.78 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  30.13 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  30.34 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  32.74 
 
 		 424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 398 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  31.99 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  33.12 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  33.83 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  31.73 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.94 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  30.03 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  32.43 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  32.37 
 
 		 435 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  31.59 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  30.85 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.37 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.46 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  30.69 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 431 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.83 
 
 		 457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  30.98 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  30.38 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  29.7 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  31.03 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  31.3 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 445 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.78 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.78 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  33.93 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  31.13 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  30.3 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.71 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  31.2 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  30.85 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  30.85 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  31.66 
 
 		 446 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  29.74 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  31.32 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  31.36 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  31.66 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.48 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.3 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  31.52 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 406 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  30.52 
 
 		 446 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.71 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  30.91 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  32.9 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  30.46 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  28.73 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  30.88 
 
 		 424 aa  99.4  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.8 
 
 		 468 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  31.02 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 379 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  29.71 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 380 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  29.22 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  30.99 
 
 		 444 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.88 
 
 		 341 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  30.14 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  31.12 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  32.86 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  30.23 
 
 		 445 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 394 aa  96.3  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 		 390 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  29.81 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  28.34 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  24.94 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  32.75 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>