More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2262 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  91.89 
 
 		 296 aa  564  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  82.77 
 
 		 296 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  81.76 
 
 		 296 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  81.76 
 
 		 296 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  80.74 
 
 		 319 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  66.89 
 
 		 299 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  72.64 
 
 		 296 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  70.1 
 
 		 300 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  69.07 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  68.97 
 
 		 296 aa  411  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  68.62 
 
 		 296 aa  407  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  68.97 
 
 		 296 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  69.76 
 
 		 299 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  67.8 
 
 		 297 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  62.03 
 
 		 298 aa  394  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  64.14 
 
 		 291 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  64.38 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  64.01 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  60.96 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  63.14 
 
 		 294 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  59.93 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  60.82 
 
 		 293 aa  360  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  59.59 
 
 		 293 aa  359  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  61.94 
 
 		 290 aa  358  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  62.12 
 
 		 294 aa  358  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  63.48 
 
 		 294 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  61.36 
 
 		 295 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  63.14 
 
 		 294 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  62.28 
 
 		 290 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  57.44 
 
 		 297 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 		 292 aa  350  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  60.69 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  57.93 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  52.9 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  55.48 
 
 		 293 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  60.55 
 
 		 299 aa  318  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 		 293 aa  305  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 292 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 292 aa  292  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  291  9e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  51.28 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  52.79 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  44.59 
 
 		 298 aa  255  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 299 aa  254  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 299 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 294 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 293 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  44.33 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  44.93 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.79 
 
 		 292 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>