59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1781 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  100 
 
 		 494 aa  993    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  74.49 
 
 		 536 aa  734    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  70.33 
 
 		 538 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  75.1 
 
 		 558 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  75.1 
 
 		 541 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  74.7 
 
 		 558 aa  747    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  88.84 
 
 		 532 aa  898    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  47.9 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  41.8 
 
 		 521 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  41.6 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  40.57 
 
 		 522 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  42.25 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  48.04 
 
 		 531 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  48.63 
 
 		 533 aa  269  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  47.02 
 
 		 521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  35.17 
 
 		 638 aa  262  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  35.68 
 
 		 535 aa  257  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  34.94 
 
 		 650 aa  253  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  33.93 
 
 		 529 aa  239  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  36.97 
 
 		 869 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 844 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 		 889 aa  193  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 		 895 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 919 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  37.23 
 
 		 895 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 889 aa  187  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 		 903 aa  187  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  38.19 
 
 		 899 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  33.05 
 
 		 863 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 863 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 862 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 		 905 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 		 917 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 863 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 		 885 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 889 aa  172  9e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  36.23 
 
 		 863 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 944 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 859 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.38 
 
 		 842 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 		 831 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 		 868 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.32 
 
 		 295 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  27.72 
 
 		 308 aa  83.2  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  27.93 
 
 		 336 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  24.3 
 
 		 555 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  24.14 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  27.46 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  25.69 
 
 		 338 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  23.86 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  26.34 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.22 
 
 		 1290 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  26.48 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  22.33 
 
 		 649 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  24.78 
 
 		 555 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  23.44 
 
 		 465 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0556  hypothetical protein  22.66 
 
 		 620 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>