More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0270 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
455 aa  877    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  66.22 
 
 
452 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.82 
 
 
454 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.77 
 
 
453 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  46.34 
 
 
456 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.34 
 
 
456 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.34 
 
 
456 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  46.31 
 
 
481 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.71 
 
 
463 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.79 
 
 
472 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  48.9 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  44.47 
 
 
461 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 
474 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  42.42 
 
 
452 aa  336  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 
476 aa  335  9e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 
457 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 
457 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  40.62 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  45.73 
 
 
472 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  36.84 
 
 
443 aa  285  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  40.58 
 
 
440 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  39.56 
 
 
433 aa  266  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  40.18 
 
 
444 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.78 
 
 
440 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  31.19 
 
 
436 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  32.96 
 
 
430 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.08 
 
 
432 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.84 
 
 
433 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  42.54 
 
 
432 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  42.64 
 
 
442 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  37.75 
 
 
438 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  37.28 
 
 
442 aa  243  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.39 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  37.19 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  40.82 
 
 
432 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.2 
 
 
447 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  37.56 
 
 
438 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  36.04 
 
 
436 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  34 
 
 
433 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  34.63 
 
 
444 aa  224  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  39.59 
 
 
438 aa  222  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.68 
 
 
437 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  38.56 
 
 
438 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  29.63 
 
 
425 aa  216  5e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.45 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  29.58 
 
 
431 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  29.65 
 
 
431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.7 
 
 
441 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.13 
 
 
445 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.62 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  25.82 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  27.03 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  25.14 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.49 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.23 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  26.49 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  25.97 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  26.49 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  26.49 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  26.49 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  26.49 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  29.49 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  31.84 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.57 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  25.68 
 
 
478 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  30.05 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  30.33 
 
 
424 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  32.46 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  30.05 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  33.53 
 
 
437 aa  64.3  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  24.61 
 
 
428 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  33.69 
 
 
439 aa  63.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.57 
 
 
488 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.5 
 
 
462 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.75 
 
 
497 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  31.75 
 
 
497 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.22 
 
 
449 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  35.76 
 
 
378 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.75 
 
 
477 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.75 
 
 
497 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  26.86 
 
 
452 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.75 
 
 
497 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.75 
 
 
497 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.75 
 
 
497 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.71 
 
 
474 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.26 
 
 
441 aa  60.1  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 
467 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  32.39 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.52 
 
 
472 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  32.13 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  32.91 
 
 
499 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.82 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.34 
 
 
464 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 
491 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.11 
 
 
477 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  30.9 
 
 
474 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  29.78 
 
 
473 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>