More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4501 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  100 
 
 		 621 aa  1244    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  37.28 
 
 		 616 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  36.15 
 
 		 623 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  33.28 
 
 		 592 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 		 621 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  34.92 
 
 		 621 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  34.86 
 
 		 621 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.66 
 
 		 633 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  33.67 
 
 		 609 aa  306  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  36.47 
 
 		 625 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  31.95 
 
 		 614 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  35.26 
 
 		 625 aa  296  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  32.55 
 
 		 604 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  36.29 
 
 		 615 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  33.99 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  32.78 
 
 		 618 aa  293  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  33.22 
 
 		 611 aa  293  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 662 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  32.42 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 616 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  34.63 
 
 		 613 aa  290  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.56 
 
 		 600 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  36.63 
 
 		 618 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 618 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  37.33 
 
 		 603 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  33.45 
 
 		 619 aa  286  7e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  36.77 
 
 		 618 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.11 
 
 		 603 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.28 
 
 		 608 aa  283  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  30.94 
 
 		 597 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  36.93 
 
 		 647 aa  281  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  38.04 
 
 		 626 aa  280  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  34.53 
 
 		 631 aa  279  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  36.03 
 
 		 615 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  37.42 
 
 		 606 aa  276  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  33.17 
 
 		 623 aa  273  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  34.46 
 
 		 625 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  33.67 
 
 		 611 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  29.39 
 
 		 605 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  37.41 
 
 		 638 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  33 
 
 		 605 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  35.29 
 
 		 673 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  35.86 
 
 		 626 aa  260  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  33.5 
 
 		 665 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  32.3 
 
 		 626 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  39.95 
 
 		 653 aa  257  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 626 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  31.87 
 
 		 608 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  36.31 
 
 		 595 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  28.21 
 
 		 591 aa  243  7e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  46.41 
 
 		 599 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  36.28 
 
 		 633 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  32.13 
 
 		 619 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  32.67 
 
 		 616 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 590 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  33.71 
 
 		 617 aa  230  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  33.73 
 
 		 608 aa  230  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  28.97 
 
 		 603 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  34.07 
 
 		 578 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 		 603 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 		 603 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.2 
 
 		 566 aa  224  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  24.83 
 
 		 594 aa  222  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  28.43 
 
 		 604 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  33.1 
 
 		 627 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  31.18 
 
 		 596 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 		 596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  46.74 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.27 
 
 		 587 aa  213  7e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.08 
 
 		 596 aa  213  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  28.31 
 
 		 611 aa  210  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  44.36 
 
 		 604 aa  209  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  25.73 
 
 		 618 aa  207  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  32.71 
 
 		 619 aa  207  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  27.32 
 
 		 626 aa  206  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  35.21 
 
 		 734 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  26.45 
 
 		 616 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  32.92 
 
 		 619 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  26.43 
 
 		 588 aa  205  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  35.21 
 
 		 521 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  34.91 
 
 		 734 aa  203  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  32.81 
 
 		 731 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  34.07 
 
 		 705 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  34.99 
 
 		 625 aa  200  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  46.84 
 
 		 611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  45 
 
 		 623 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.3 
 
 		 575 aa  199  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  36.47 
 
 		 590 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.84 
 
 		 1003 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  31.52 
 
 		 596 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 624 aa  197  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.68 
 
 		 971 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.6 
 
 		 976 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.7 
 
 		 592 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  30.33 
 
 		 700 aa  196  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  34.91 
 
 		 577 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  34.91 
 
 		 577 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.34 
 
 		 640 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.83 
 
 		 613 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>