More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0474 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 246 aa  490  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  37.86 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.28 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.54 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.87 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.87 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.87 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.87 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.87 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.48 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  28.82 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  25.75 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  30.12 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  26.99 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.82 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  27.23 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  29.26 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  28.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  30.82 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1940  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331294  normal  0.596392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  53.85 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0903  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.634151 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.71 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.8 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  25.75 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  25.75 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  22.12 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  38.46 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  28.38 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  47.95 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>