247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_18431 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  97.95 
 
 
440 aa  838    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  100 
 
 
440 aa  886    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  45.91 
 
 
440 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  42.33 
 
 
441 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  39.81 
 
 
420 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  39.74 
 
 
413 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  37.82 
 
 
413 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.17 
 
 
431 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.43 
 
 
413 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  34.77 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.51 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  30.4 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  29.76 
 
 
479 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  30.12 
 
 
566 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  29.76 
 
 
479 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.54 
 
 
492 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  29.09 
 
 
489 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  27.21 
 
 
484 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  31.13 
 
 
462 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  27.49 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  31.23 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  31.23 
 
 
448 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.88 
 
 
457 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  28.9 
 
 
469 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  29.5 
 
 
481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  28.96 
 
 
499 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.08 
 
 
517 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  23.91 
 
 
506 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.51 
 
 
513 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  28.25 
 
 
499 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  24.29 
 
 
531 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  23.93 
 
 
531 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.71 
 
 
499 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  23.34 
 
 
529 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  26.03 
 
 
529 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.78 
 
 
529 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  23.05 
 
 
520 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  26.05 
 
 
516 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.51 
 
 
532 aa  93.2  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  24.14 
 
 
545 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.73 
 
 
496 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  25 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.3 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  22.26 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  24.48 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  23.72 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.01 
 
 
471 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  24.3 
 
 
463 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  34.34 
 
 
398 aa  63.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  21.86 
 
 
481 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  28.87 
 
 
291 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  28.48 
 
 
295 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  28.5 
 
 
314 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  28.12 
 
 
635 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  34.15 
 
 
473 aa  53.9  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  33.07 
 
 
496 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  18.68 
 
 
475 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  24.55 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  21.86 
 
 
1219 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  27.45 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  26.57 
 
 
290 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  26.57 
 
 
290 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  28.29 
 
 
650 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  25.35 
 
 
290 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  25.82 
 
 
294 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  26.57 
 
 
290 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  26.57 
 
 
290 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  31.75 
 
 
434 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  24.56 
 
 
291 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  28.79 
 
 
299 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  28.79 
 
 
299 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  30.37 
 
 
370 aa  50.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  27.15 
 
 
291 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  28.79 
 
 
287 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.41 
 
 
287 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  20.49 
 
 
1219 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  31.11 
 
 
294 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  25.77 
 
 
312 aa  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  29.69 
 
 
439 aa  49.7  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  20.49 
 
 
1219 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  20.49 
 
 
1219 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  20.9 
 
 
1219 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  27.78 
 
 
311 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  28.91 
 
 
299 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  20.49 
 
 
1219 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  31.4 
 
 
302 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  31.85 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  20.49 
 
 
1219 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.39 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  27.48 
 
 
297 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  25.71 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  29.37 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.41 
 
 
1219 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  26.11 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  28.03 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  26.11 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  22.41 
 
 
1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  30.16 
 
 
434 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  25.87 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  26.11 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>