208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3174 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
396 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  79.72 
 
 
414 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  69.62 
 
 
399 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  69.62 
 
 
399 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  69.62 
 
 
399 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  63.24 
 
 
387 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  59.03 
 
 
414 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  59.23 
 
 
435 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  59.17 
 
 
400 aa  353  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  54.62 
 
 
447 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 
408 aa  344  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  54.27 
 
 
421 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  48.51 
 
 
439 aa  262  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  44.2 
 
 
403 aa  255  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  41.9 
 
 
428 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 
398 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  38.12 
 
 
437 aa  162  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
387 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
385 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.95 
 
 
384 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  33.6 
 
 
417 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.06 
 
 
405 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.47 
 
 
386 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
386 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
402 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
383 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  30.34 
 
 
397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.2 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  32.19 
 
 
396 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
397 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  33.33 
 
 
403 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  30.88 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  32.09 
 
 
384 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.2 
 
 
400 aa  126  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
391 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
390 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  35.22 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  26.8 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.04 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  33.33 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  29.95 
 
 
408 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
381 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  30.19 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  31.3 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
407 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
409 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  33.05 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  33.06 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
394 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  32.37 
 
 
439 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  31.18 
 
 
388 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
465 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
405 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  32.43 
 
 
396 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
425 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 
390 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  30.95 
 
 
403 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
373 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
394 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
387 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  27.6 
 
 
383 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  31.93 
 
 
404 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  31.93 
 
 
404 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  27.08 
 
 
402 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
402 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  27.08 
 
 
402 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
384 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  27.08 
 
 
402 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  27.34 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  26.82 
 
 
402 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  27.08 
 
 
402 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  27.91 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  26.82 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 
464 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1083  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
436 aa  97.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.63 
 
 
372 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  27.37 
 
 
385 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  27.37 
 
 
385 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  27.65 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.45 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  27.54 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  34.33 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
402 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  28.27 
 
 
392 aa  94  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  26.29 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  29.93 
 
 
443 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>