More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2912 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  69.31 
 
 
290 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  67.7 
 
 
291 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  67.27 
 
 
287 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  62.59 
 
 
291 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  62.59 
 
 
291 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  62.59 
 
 
291 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  48.76 
 
 
350 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
361 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  48.03 
 
 
301 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  48.92 
 
 
333 aa  252  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
298 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  44.01 
 
 
314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  45.91 
 
 
340 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  46.9 
 
 
350 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
340 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
340 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 
340 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  45.74 
 
 
341 aa  232  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  45.82 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 
322 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  36.09 
 
 
296 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
275 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
281 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
308 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
284 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
340 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.05 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
300 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  35.25 
 
 
275 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  28.38 
 
 
300 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
270 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
267 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.72 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
280 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  33.92 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
323 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.72 
 
 
300 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  28.38 
 
 
300 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 
270 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  28.38 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  28.38 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  28.38 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  31.16 
 
 
302 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
270 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
271 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
312 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
288 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
299 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
339 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
304 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
291 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
283 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.04 
 
 
300 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
276 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
316 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
291 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
283 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
287 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
287 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
287 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
279 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  32.58 
 
 
312 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
290 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
287 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
292 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
284 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
279 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
271 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
346 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
284 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  29.24 
 
 
313 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
302 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
286 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
329 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  33.46 
 
 
291 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 
268 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.65 
 
 
262 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
312 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
283 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
264 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
283 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  28.32 
 
 
313 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
312 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
300 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
287 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
316 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
267 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
278 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
295 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>