More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0431 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  100 
 
 		 374 aa  745    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  58.2 
 
 		 373 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  48.55 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  43.57 
 
 		 350 aa  300  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  43.44 
 
 		 360 aa  299  7e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  45.4 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  47.91 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.36 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  40.99 
 
 		 367 aa  269  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  47.52 
 
 		 301 aa  262  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  44.9 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  42.81 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  40.82 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  41 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  40.36 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  40.53 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  41.47 
 
 		 355 aa  248  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  45.05 
 
 		 363 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  37.39 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  37.1 
 
 		 348 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  36.9 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  37.1 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  36.55 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  34.97 
 
 		 358 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  40.48 
 
 		 370 aa  230  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  41.87 
 
 		 349 aa  229  9e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  40.75 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  40.5 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  36.73 
 
 		 359 aa  224  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  42.36 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  35.14 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  40.2 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  37.62 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  38.01 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  40.13 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  37.67 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  36.44 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  40.25 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  40.18 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  42.09 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.61 
 
 		 346 aa  209  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  38.66 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  41.79 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  41.79 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  41.79 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  37.93 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  37.36 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  41.85 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  32.14 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  36.16 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  39.04 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  36.65 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  34 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.03 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  40.73 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.14 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  41.53 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  37.35 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  37.65 
 
 		 359 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  37.35 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  33.62 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  37.35 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  37.06 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  38.33 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  36.42 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  38.27 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  36.91 
 
 		 347 aa  186  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  39.39 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  35.65 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  32.2 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  36.5 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  35.88 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.33 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  34.6 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  36.75 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  34.9 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  38.11 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.67 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  36.52 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  37.5 
 
 		 347 aa  182  8.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  34.64 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.03 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  34.08 
 
 		 372 aa  179  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  33.24 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  37.58 
 
 		 344 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  34.81 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  32.35 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  33.24 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  31.21 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  33.86 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  34.98 
 
 		 330 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  30.68 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  35.65 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  34.48 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  32.63 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>