203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2131 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 444 aa  884    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  36.34 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  34.94 
 
 		 460 aa  144  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  30.44 
 
 		 469 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  28.82 
 
 		 471 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  32.52 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  29.2 
 
 		 495 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  27.56 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  27.45 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  26.82 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  30.22 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  29.45 
 
 		 488 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  29.11 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  25.37 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  25.54 
 
 		 474 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  27.04 
 
 		 482 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  29.4 
 
 		 471 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  24.63 
 
 		 473 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  25.17 
 
 		 473 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 473 aa  97.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  24.74 
 
 		 473 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  28.34 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  30.73 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  25.32 
 
 		 491 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.64 
 
 		 441 aa  93.2  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  24.72 
 
 		 456 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  25.93 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  28.91 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  25.82 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  25.44 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  28.48 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  27.08 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  23.22 
 
 		 466 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  23.22 
 
 		 466 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  25.92 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  25.2 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  24.06 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  27.46 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  29.68 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  23.82 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  25.08 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  28.23 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  27.11 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  29.48 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  20.53 
 
 		 722 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  25.54 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  27.88 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  21.32 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  24.95 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  26.39 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  28.6 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  29.51 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  28.6 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  28.51 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  28.27 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.77 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  28.6 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  20.39 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  23.41 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  27.63 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  26.93 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  27.85 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  24.14 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  25.78 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  35.2 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  24.86 
 
 		 589 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.24 
 
 		 523 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  27.87 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  30.1 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  19.2 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  18.85 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  39.62 
 
 		 531 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  25.79 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  26.53 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  25.79 
 
 		 488 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  29.11 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  40.26 
 
 		 349 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  28.36 
 
 		 511 aa  53.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  28.71 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  21.32 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  32.99 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  25.94 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  28.67 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  23.52 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  32.99 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  32.99 
 
 		 485 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  32.99 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  32.99 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  22.88 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  24.12 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>