More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3875 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3875  inner-membrane translocator  100 
 
 		 347 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3801  inner-membrane translocator  94.93 
 
 		 347 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3493  inner-membrane translocator  95.82 
 
 		 347 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2546  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  71.92 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3003  inner-membrane translocator  64.76 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2750  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  64.13 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43520  amino acid ABC transporter-like protein  60.87 
 
 		 355 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00847282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0551  inner-membrane translocator  58.97 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43760  LivM family inner-membrane translocator  62.31 
 
 		 352 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2988  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.1 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  53.08 
 
 		 351 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7158  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  58.31 
 
 		 350 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  53.23 
 
 		 358 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  50.3 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  50.45 
 
 		 358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4296  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  58.2 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  decreased coverage  0.00201809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  52 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2985  inner-membrane translocator  59.94 
 
 		 355 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.538372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  49.69 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5009  inner-membrane translocator  52 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  46.6 
 
 		 358 aa  285  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1436  inner-membrane translocator  59.93 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476305  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  46.42 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  46.91 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3539  inner-membrane translocator  48.47 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.17747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0784  inner-membrane translocator  50.48 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  47.83 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0458  inner-membrane translocator  47.83 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441083  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3437  inner-membrane translocator  50.16 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  46.6 
 
 		 358 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  46.48 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  44.89 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.99 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  56.21 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  45.37 
 
 		 358 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  44.68 
 
 		 384 aa  242  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  45.76 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.96 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 348 aa  162  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  37.17 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 346 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  35 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 356 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.77 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 		 357 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  33.95 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 358 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.66 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1567  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  34.26 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4574  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1557  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 357 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.505429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 357 aa  126  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 327 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 571 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4480  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  32.17 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  31.77 
 
 		 643 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.41 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  31.21 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.55 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>