More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0551 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0551  inner-membrane translocator  100 
 
 		 355 aa  683    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43520  amino acid ABC transporter-like protein  85.07 
 
 		 355 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00847282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2988  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  78.59 
 
 		 355 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2985  inner-membrane translocator  83.66 
 
 		 355 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.538372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  79.15 
 
 		 329 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  61.17 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  61.45 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  61.45 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  59.28 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2750  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  65 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3003  inner-membrane translocator  65.62 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43760  LivM family inner-membrane translocator  65.07 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  61.44 
 
 		 351 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5009  inner-membrane translocator  55.21 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  52.66 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  50 
 
 		 358 aa  359  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3539  inner-membrane translocator  49.86 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.17747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  49.3 
 
 		 358 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0458  inner-membrane translocator  49.03 
 
 		 358 aa  345  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441083  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3437  inner-membrane translocator  54.65 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  51.25 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0784  inner-membrane translocator  54.65 
 
 		 354 aa  339  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4296  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.51 
 
 		 351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  decreased coverage  0.00201809 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  52.34 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  49.86 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.14 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7158  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  60.76 
 
 		 350 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3875  inner-membrane translocator  59.03 
 
 		 347 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3801  inner-membrane translocator  58.39 
 
 		 347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2546  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.96 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  48.9 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3493  inner-membrane translocator  58.71 
 
 		 347 aa  319  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  48.61 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  48.2 
 
 		 358 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1436  inner-membrane translocator  59.01 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476305  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 349 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  39.49 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  41.59 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  37.82 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  36.97 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  38.2 
 
 		 357 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 373 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.87 
 
 		 357 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 357 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1567  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 357 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1557  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.505429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4574  inner-membrane translocator  37.43 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  34.28 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  35.63 
 
 		 381 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 562 aa  144  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.78 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.56 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.44 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  32 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 571 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 454 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 435 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  31.17 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.44 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>