More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43520 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_43520  amino acid ABC transporter-like protein  100 
 
 		 355 aa  682    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00847282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0551  inner-membrane translocator  85.07 
 
 		 355 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2985  inner-membrane translocator  87.04 
 
 		 355 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.538372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2988  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  77.75 
 
 		 355 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  82.82 
 
 		 329 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  61.56 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  61.84 
 
 		 358 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  59.5 
 
 		 358 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  59.39 
 
 		 358 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3003  inner-membrane translocator  67.47 
 
 		 354 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2750  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  66.87 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43760  LivM family inner-membrane translocator  67.47 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5009  inner-membrane translocator  56.9 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  61.44 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  52.23 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  51.25 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  52.68 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  53.2 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  50.97 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0458  inner-membrane translocator  50.7 
 
 		 358 aa  355  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3539  inner-membrane translocator  53.35 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.17747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3437  inner-membrane translocator  56.9 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0784  inner-membrane translocator  55.21 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3801  inner-membrane translocator  60.97 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  50.56 
 
 		 368 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  50.42 
 
 		 358 aa  342  5.999999999999999e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.42 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  50.42 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7158  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  60.44 
 
 		 350 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3493  inner-membrane translocator  61.61 
 
 		 347 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  53.44 
 
 		 362 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3875  inner-membrane translocator  60.65 
 
 		 347 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  49.72 
 
 		 358 aa  332  9e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2546  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  61.99 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4296  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.39 
 
 		 351 aa  328  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  decreased coverage  0.00201809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  48.08 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1436  inner-membrane translocator  62.83 
 
 		 344 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476305  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  41.83 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.24 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  37.68 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  37.43 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 357 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.67 
 
 		 357 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 357 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  36.01 
 
 		 355 aa  175  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1567  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4574  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1557  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.505429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 381 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 562 aa  145  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.81 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 571 aa  133  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.53 
 
 		 325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.78 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 335 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.11 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  29.81 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 454 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>