64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3545 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  62.62 
 
 		 224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  35.62 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 511 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  47.62 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  38.27 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 507 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  39.68 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  30.38 
 
 		 870 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  31.58 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  33.71 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  34.26 
 
 		 668 aa  45.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  29.46 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  35.53 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 1476 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.91 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0045  Methyltransferase type 12  42.59 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  48.89 
 
 		 1162 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.43 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  47.06 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 322 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  30.68 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  39.06 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  39.06 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.17 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2563  hypothetical protein  31.96 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  29.59 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.17 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  28.83 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14886  predicted protein  28.15 
 
 		 309 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 706 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.17 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0410  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0301  hypothetical protein  35.38 
 
 		 240 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1124 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0306  hypothetical protein  35.38 
 
 		 133 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  32.03 
 
 		 268 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 262 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.64 
 
 		 239 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3434  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 286 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>