66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2374 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  48.4 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  39.35 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  38.02 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  38.83 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  38.52 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  38.52 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  38.52 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  42.74 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  36.86 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  39.71 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  32.78 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  36.84 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  29.89 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  31.01 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  26.9 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  35.79 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  25.65 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  26.32 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  26.15 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  34.17 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  27.4 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  28.69 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  28.7 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  52.54 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  52.54 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  52.54 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  30.64 
 
 		 269 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  31.58 
 
 		 372 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1566  hypothetical protein  35.14 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902821  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  35.96 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  34.07 
 
 		 391 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  34.07 
 
 		 391 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  38.96 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  34.71 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  30.58 
 
 		 171 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  28.32 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  48.33 
 
 		 425 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  34.44 
 
 		 173 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  31.3 
 
 		 175 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  29.29 
 
 		 362 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 346 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 359 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  34.04 
 
 		 356 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  43.64 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  43.64 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  31.06 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  30 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  26.19 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  30.28 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  29.55 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  26.87 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  30.85 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  32 
 
 		 177 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  39.39 
 
 		 370 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  28.06 
 
 		 160 aa  43.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  29.09 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  42.19 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  28.7 
 
 		 399 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  27.59 
 
 		 383 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  37.31 
 
 		 173 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>