More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0368 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0368  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  47.47 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 316 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0425  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 284 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 279 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6632  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  36.17 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6152  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5787  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 284 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  37.23 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0006  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0006  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0413  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 302 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7706  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6037  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0014  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5807  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 283 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2586  transcriptional regulator LysR family  37.5 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  35.93 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  36.13 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 		 290 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4357  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1608  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05533  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3803  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 293 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2882  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  34.38 
 
 		 287 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4219  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4068  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0243  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 288 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 283 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0242  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>