More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2116 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  68.32 
 
 		 508 aa  726    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  61.95 
 
 		 505 aa  653    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 511 aa  1054    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  66.8 
 
 		 514 aa  714    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 515 aa  620  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 561 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 510 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 501 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 493 aa  487  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 573 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 573 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 491 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 573 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 523 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 513 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 489 aa  465  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 505 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 494 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 502 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 631 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 489 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 489 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1491  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00494369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.45 
 
 		 498 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 496 aa  450  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 514 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2240  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  48.65 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 647 aa  445  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 508 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 492 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 492 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 511 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 492 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0903  lysyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0576  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 506 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0138803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>