More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0576 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  65.31 
 
 		 501 aa  672    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0576  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 506 aa  1039    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0138803  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  63.97 
 
 		 503 aa  667    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1273  lysyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 504 aa  666    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507686  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0488  lysyl-tRNA synthetase  63.89 
 
 		 500 aa  652    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  65.31 
 
 		 501 aa  672    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  64.91 
 
 		 501 aa  669    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  64.57 
 
 		 503 aa  674    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1142  lysyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 504 aa  622  1e-177  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0716049  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1646  lysyl-tRNA synthetase  60.84 
 
 		 499 aa  617  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 494 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 491 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 492 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 492 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  52.03 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 492 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  52.03 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 504 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  54.82 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  50.72 
 
 		 491 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 504 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 505 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 505 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  54.82 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 503 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 532 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 491 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 501 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 502 aa  483  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 502 aa  478  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 507 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  50.74 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 494 aa  467  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 577 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 501 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 495 aa  465  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  50.32 
 
 		 496 aa  465  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 496 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1008  lysyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 496 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1204  lysyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.325374  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 513 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5248  lysyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 519 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 489 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0152  lysyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.0072128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3620  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>