More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1273 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0576  lysyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 506 aa  649    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0138803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 503 aa  636    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1273  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 504 aa  1027    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507686  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 501 aa  630  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  60.16 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 501 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1142  lysyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 		 504 aa  618  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0716049  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 503 aa  608  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0488  lysyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 		 500 aa  599  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1646  lysyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 494 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 491 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 505 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 505 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 505 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 505 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 505 aa  501  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  52.22 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 505 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  52.22 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 492 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 501 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 492 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 511 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  51.52 
 
 		 505 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 503 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  49.9 
 
 		 491 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  51.52 
 
 		 505 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 499 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 496 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  51.86 
 
 		 496 aa  475  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  51.86 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  49.6 
 
 		 501 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1054  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 514 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004437  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.7 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 484 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 499 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1456  lysyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370095  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00960  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0195  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00927236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 488 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2877  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0566  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 499 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 499 aa  458  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0048  lysyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0583  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 500 aa  458  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>