More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1646 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0488  lysyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 500 aa  679    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  68.53 
 
 		 501 aa  714    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1646  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 499 aa  1016    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 501 aa  713    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  70.51 
 
 		 503 aa  734    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 501 aa  712    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  68.08 
 
 		 503 aa  722    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1142  lysyl-tRNA synthetase  78.23 
 
 		 504 aa  816    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0716049  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0576  lysyl-tRNA synthetase  60.84 
 
 		 506 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0138803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1273  lysyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 504 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 502 aa  495  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 532 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 492 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 501 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 491 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 492 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 492 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 503 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 496 aa  475  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  48.27 
 
 		 491 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 493 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 507 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  46.93 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  46.93 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 511 aa  458  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 494 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 516 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 499 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 509 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 508 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 502 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 513 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  45.75 
 
 		 505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  45.75 
 
 		 505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 497 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3975  lysyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 561 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.761967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 505 aa  445  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>