More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1491 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2240  lysyl-tRNA synthetase  82.93 
 
 
503 aa  828    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102374  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1491  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
502 aa  1025    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00494369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0903  lysyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 
512 aa  607  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
490 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
499 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
523 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
491 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
573 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
573 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
489 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
494 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
495 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
509 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
504 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
499 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
489 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
488 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
512 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
495 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
499 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
573 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
561 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
511 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
501 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
505 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
501 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
577 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.98 
 
 
498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  48.28 
 
 
505 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
505 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  48.28 
 
 
505 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
505 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
505 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
505 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
505 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
499 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
496 aa  450  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
489 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
503 aa  448  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
505 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  48 
 
 
508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
501 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
515 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
489 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
504 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
505 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
498 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
499 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
502 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  48.57 
 
 
505 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
505 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
505 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
508 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
503 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
505 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
505 aa  438  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
505 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
505 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
505 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
505 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
631 aa  435  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
505 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
508 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
503 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
502 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
505 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
505 aa  438  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  48.57 
 
 
505 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
505 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
509 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
505 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
502 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
512 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
505 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
496 aa  432  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
514 aa  433  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>