More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5888 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 389 aa  765    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0564  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5311  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 372 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4235  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0474361  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 375 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4086  glycosyl transferase, group 1  36.48 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789956  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14181  hypothetical protein  25.36 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0054  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4210  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  29.11 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  32.26 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1421  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3700  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  29.05 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.13 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  32.23 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1153  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.568345  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  30.36 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  32.5 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  36.81 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  32.23 
 
 		 806 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  33.51 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  25.45 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.8 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  29.36 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  27.27 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  26.97 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 		 353 aa  57  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  36.84 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  37.96 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  26.12 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  31.12 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.24 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.49 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  37.25 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 810 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.49 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  31.9 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  45.71 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  34.96 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  27.86 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  44.07 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  31.38 
 
 		 440 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  30.87 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  41.86 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  21.54 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30.3 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  21.79 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>