61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5205 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5205  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 		 444 aa  879    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2949  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  74.88 
 
 		 438 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0366338  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2275  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.63 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.37 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2221  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  37.31 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0052  Fis family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0380  high-affinity branched-chain amino acid transport system periplasmic binding protein livK  35 
 
 		 426 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5035  hypothetical protein  32.52 
 
 		 441 aa  232  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0119  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid binding protein, putative  34.72 
 
 		 427 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4004  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid binding protein  32.91 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5149  hypothetical protein  32.3 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0264  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  32.75 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3494  hypothetical protein  34.92 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3802  hypothetical protein  35.19 
 
 		 457 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0218  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  31.73 
 
 		 445 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43750  hypothetical protein  32.43 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.675363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3538  hypothetical protein  31.31 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000073392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3611  hypothetical protein  31.06 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.426846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2752  hypothetical protein  32.59 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2547  hypothetical protein  33.59 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.845689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3876  hypothetical protein  34.13 
 
 		 454 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3438  hypothetical protein  30.36 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3001  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.32 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0466  hypothetical protein  30.81 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.909099  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4295  hypothetical protein  32 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  decreased coverage  0.00229611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0457  hypothetical protein  30.81 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.734895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0253  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  31.16 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0750632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5010  hypothetical protein  31.04 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.86 
 
 		 466 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1435  hypothetical protein  33.41 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  hitchhiker  0.00000490769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2751  hypothetical protein  31.63 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2984  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.07 
 
 		 441 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7160  hypothetical protein  32.4 
 
 		 449 aa  193  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2770  hypothetical protein  31.07 
 
 		 441 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2721  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  30.53 
 
 		 441 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178646  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43730  hypothetical protein  31.69 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2987  hypothetical protein  31.68 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0552  hypothetical protein  31.99 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0600  hypothetical protein  30.62 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43720  hypothetical protein  31.51 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43510  hypothetical protein  32.08 
 
 		 441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0230529  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0565  hypothetical protein  30.83 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0783  hypothetical protein  28.18 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1155  hypothetical protein  28.89 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0965806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7159  hypothetical protein  28.24 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907788  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5291  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  26.34 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  23.18 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  22.55 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3413  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  20.15 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3839  extracellular ligand-binding receptor  22.69 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0951081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0404  Extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 		 400 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0029  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3506  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  30.4 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2357  extracellular ligand-binding receptor  22.5 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0768636  normal  0.579443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2607  putative branched-chain amino acid ABC transporter  20.51 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2379  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  24.23 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000400  ABC transporter substrate-binding protein  19.95 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>