More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1211 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  93.68 
 
 		 209 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 183 aa  197  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 182 aa  185  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  50.27 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  51.1 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  50.82 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  50.55 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  50.55 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  50.55 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  50.55 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  51.65 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  50.27 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  49.45 
 
 		 182 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  42.08 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  36.22 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  32.97 
 
 		 178 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.43 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  32.43 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  32.43 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  32.43 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  31.89 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  30.81 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  34.81 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  33.86 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  35.58 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  31.28 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 259 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  31.28 
 
 		 260 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  31.11 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 248 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 190 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  30.86 
 
 		 190 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  30.86 
 
 		 190 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  30.86 
 
 		 190 aa  98.2  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  30.29 
 
 		 190 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  30.86 
 
 		 190 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  30.86 
 
 		 190 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  30.86 
 
 		 190 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  30.86 
 
 		 190 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  30.86 
 
 		 190 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  27.68 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  27.04 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  29.79 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  29.79 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  29.95 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.96 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  34.69 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  30.67 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  26.55 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3140  transcriptional regulator, XRE family  25.99 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  27.71 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  27.01 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  27.16 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  27.01 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  24.71 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  28.9 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  26.54 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>