More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1906 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  876    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  64.15 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 442 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  61.94 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4753  seryl-tRNA synthetase  62.76 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 435 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4234  seryl-tRNA synthetase  62.06 
 
 		 428 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4604  seryl-tRNA synthetase  62.06 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0722  seryl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 423 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 430 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  62.23 
 
 		 425 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0519  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.306862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2742  seryl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 476 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51517  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2282  seryl-tRNA synthetase  58.48 
 
 		 467 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3185  seryl-tRNA synthetase  58.8 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4404  seryl-tRNA synthetase  55.7 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7399  seryl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38893  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0586  seryl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4414  seryl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 442 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1791  seryl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 470 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.419973  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6577  seryl-tRNA synthetase  60.97 
 
 		 435 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1863  seryl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.517326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003876  seryl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 435 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00729663  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2517  seryl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 481 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0204633  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01800  seryl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 423 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 426 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 426 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1844  seryl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 435 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0308873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0994  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 430 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2429  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.614056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1686  seryl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.162047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 428 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 430 aa  464  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0437  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0193411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 424 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 433 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>