143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0049 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  663  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  52.81 
 
 
338 aa  321  1e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  50.33 
 
 
337 aa  292  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  46.98 
 
 
335 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  49.66 
 
 
332 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  49.33 
 
 
332 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  46.01 
 
 
337 aa  282  7e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  48.68 
 
 
317 aa  272  5e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  44.1 
 
 
343 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  43.79 
 
 
356 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  42.81 
 
 
338 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  42.5 
 
 
338 aa  244  2e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  40.26 
 
 
360 aa  240  3e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  42.58 
 
 
362 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  42.58 
 
 
362 aa  239  6e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  39.94 
 
 
360 aa  239  6e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  39.94 
 
 
360 aa  238  7e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  42.35 
 
 
338 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  1.492e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  41.37 
 
 
338 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  38.76 
 
 
335 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  37.46 
 
 
335 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  37.38 
 
 
335 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  31.8 
 
 
332 aa  180  3e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  32.59 
 
 
332 aa  179  5e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  38.89 
 
 
335 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  39.26 
 
 
308 aa  174  2e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  36.04 
 
 
335 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  32.26 
 
 
309 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  32.96 
 
 
329 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  33.01 
 
 
330 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  30 
 
 
340 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  30 
 
 
340 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  30 
 
 
340 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  30 
 
 
340 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  29.93 
 
 
340 aa  113  4e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  29.93 
 
 
348 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  29.81 
 
 
354 aa  112  7e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  30.33 
 
 
328 aa  111  1e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  29.61 
 
 
340 aa  111  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  34.29 
 
 
348 aa  110  4e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  29.14 
 
 
335 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  27.88 
 
 
356 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  31.65 
 
 
338 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  34.53 
 
 
348 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  28.01 
 
 
349 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  27.63 
 
 
351 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  31.31 
 
 
338 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  28.16 
 
 
361 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  30.08 
 
 
336 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  28.08 
 
 
341 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  28.21 
 
 
361 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  7.23693e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  28.21 
 
 
361 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  28.21 
 
 
361 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  27.9 
 
 
356 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  26.96 
 
 
356 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  27.9 
 
 
356 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  27.59 
 
 
356 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  30.18 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.51 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.74 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  29.58 
 
 
331 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  28.77 
 
 
330 aa  95.9  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  29.58 
 
 
331 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  27.55 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  29.45 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  29.58 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  25.73 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.34 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  29.33 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  25.93 
 
 
329 aa  93.2  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  26.1 
 
 
361 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  26.92 
 
 
325 aa  92.8  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  28.03 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  26.45 
 
 
366 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  29.93 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  26.84 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.46 
 
 
364 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  27.21 
 
 
353 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  26.16 
 
 
366 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  27.81 
 
 
357 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  26.45 
 
 
366 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  27.67 
 
 
388 aa  85.9  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  26.45 
 
 
366 aa  85.5  1e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  28.18 
 
 
366 aa  84.3  2e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  28.18 
 
 
366 aa  84.3  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  28.18 
 
 
366 aa  84.3  3e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  28.18 
 
 
366 aa  84.3  3e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  28.18 
 
 
366 aa  84.3  3e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  28.18 
 
 
366 aa  84.3  3e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  28.18 
 
 
366 aa  84.3  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  28.18 
 
 
366 aa  84.3  3e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  27.96 
 
 
337 aa  83.6  4e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0636  hypothetical protein  27.83 
 
 
362 aa  83.2  5e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  26.19 
 
 
363 aa  82.8  7e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.96 
 
 
349 aa  82.8  7e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  25 
 
 
362 aa  82.8  8e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.17 
 
 
346 aa  81.3  2e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.41 
 
 
388 aa  81.6  2e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  27.1 
 
 
338 aa  81.3  2e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  26.71 
 
 
366 aa  81.3  2e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>