More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2256 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 316 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  54.93 
 
 		 611 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  52.82 
 
 		 675 aa  316  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  52.28 
 
 		 673 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  53.17 
 
 		 580 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  52.46 
 
 		 583 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  49.47 
 
 		 670 aa  296  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  49.13 
 
 		 683 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  47.74 
 
 		 569 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  49.83 
 
 		 728 aa  292  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  47.77 
 
 		 806 aa  291  8e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  50.7 
 
 		 607 aa  288  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  49.83 
 
 		 725 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  46.37 
 
 		 777 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  50.52 
 
 		 663 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  46.34 
 
 		 676 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  46.34 
 
 		 676 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  48.32 
 
 		 708 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  49.47 
 
 		 661 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  49.31 
 
 		 673 aa  279  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  49.65 
 
 		 659 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.9 
 
 		 680 aa  276  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  48.43 
 
 		 676 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  46.83 
 
 		 655 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  45.94 
 
 		 661 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  45.86 
 
 		 661 aa  272  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  47.77 
 
 		 709 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  46.1 
 
 		 658 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  43.01 
 
 		 592 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  45.45 
 
 		 661 aa  258  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45.58 
 
 		 586 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  41.81 
 
 		 589 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  42.07 
 
 		 587 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  40.77 
 
 		 686 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.64 
 
 		 644 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  40.93 
 
 		 659 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  41.72 
 
 		 677 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  40.31 
 
 		 783 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  41.45 
 
 		 636 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  41.5 
 
 		 794 aa  212  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  38.41 
 
 		 799 aa  209  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  42.12 
 
 		 829 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  41.18 
 
 		 793 aa  208  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  39.33 
 
 		 675 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  39.17 
 
 		 787 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  39.67 
 
 		 675 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  38.54 
 
 		 778 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  39.74 
 
 		 790 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  36.57 
 
 		 608 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  38.76 
 
 		 710 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 793 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  38.87 
 
 		 647 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  38.44 
 
 		 763 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  36.07 
 
 		 725 aa  179  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  57.72 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  43.72 
 
 		 552 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  34.44 
 
 		 691 aa  156  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  29.17 
 
 		 522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  29.26 
 
 		 498 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  28.3 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.89 
 
 		 587 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  27.78 
 
 		 574 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  38.17 
 
 		 196 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  28.66 
 
 		 574 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  28.86 
 
 		 574 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.57 
 
 		 498 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  30.48 
 
 		 511 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  28.72 
 
 		 496 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  28.66 
 
 		 500 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  28.92 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.21 
 
 		 499 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  29.86 
 
 		 585 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 		 496 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.31 
 
 		 504 aa  99.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  29.33 
 
 		 505 aa  99.4  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.62 
 
 		 633 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  26.12 
 
 		 822 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  29.68 
 
 		 516 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  28.62 
 
 		 505 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  27.81 
 
 		 501 aa  95.5  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  26.48 
 
 		 510 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26.87 
 
 		 808 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  27.68 
 
 		 495 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.23 
 
 		 508 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  27.27 
 
 		 495 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  28.67 
 
 		 499 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  26.32 
 
 		 505 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  26.6 
 
 		 523 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  26.6 
 
 		 523 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.33 
 
 		 815 aa  90.9  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  26.6 
 
 		 508 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  28.95 
 
 		 520 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  28.95 
 
 		 520 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.43 
 
 		 708 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  25.26 
 
 		 510 aa  90.5  3e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1127  N-6 DNA methylase  28 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  25.57 
 
 		 503 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.83 
 
 		 503 aa  89.4  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  26.26 
 
 		 508 aa  89.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  26.82 
 
 		 814 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>