273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2227 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 371 aa  764    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  53.3 
 
 		 659 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  51.59 
 
 		 661 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  56.35 
 
 		 655 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  51.06 
 
 		 661 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  50.52 
 
 		 673 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  49.47 
 
 		 661 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  50.53 
 
 		 658 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  51.32 
 
 		 670 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  49.88 
 
 		 683 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  51.56 
 
 		 661 aa  354  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  48.35 
 
 		 680 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  50 
 
 		 663 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  46.17 
 
 		 708 aa  343  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  44.66 
 
 		 728 aa  342  8e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  47.89 
 
 		 673 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  43.54 
 
 		 725 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  48.28 
 
 		 676 aa  329  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  46.8 
 
 		 686 aa  322  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  45.92 
 
 		 676 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  45.92 
 
 		 676 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  44.36 
 
 		 659 aa  315  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  49.32 
 
 		 611 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  44.3 
 
 		 675 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  39.96 
 
 		 777 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.53 
 
 		 644 aa  294  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  43.8 
 
 		 675 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  47.84 
 
 		 677 aa  273  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  62.5 
 
 		 675 aa  265  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  38.97 
 
 		 709 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  58.22 
 
 		 580 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  43.8 
 
 		 647 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  48.84 
 
 		 806 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  60 
 
 		 586 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  36.34 
 
 		 793 aa  235  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  38.56 
 
 		 725 aa  233  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  41.58 
 
 		 710 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  38.26 
 
 		 691 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  57.89 
 
 		 607 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  56.77 
 
 		 569 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  37.57 
 
 		 636 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  53.93 
 
 		 583 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  52.66 
 
 		 783 aa  199  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  53.3 
 
 		 787 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  51.3 
 
 		 587 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  47.37 
 
 		 794 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  51.31 
 
 		 592 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  49.48 
 
 		 589 aa  186  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  48.5 
 
 		 793 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  52.41 
 
 		 829 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  54.44 
 
 		 778 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  49.17 
 
 		 763 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  49.72 
 
 		 790 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  53.01 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  52.41 
 
 		 608 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  37.62 
 
 		 799 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  49.57 
 
 		 697 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  58.11 
 
 		 356 aa  99.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  38.82 
 
 		 574 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  38.03 
 
 		 574 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.58 
 
 		 587 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  37.59 
 
 		 574 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  36.17 
 
 		 585 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  31.12 
 
 		 495 aa  85.9  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  31.13 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  33.55 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  33.75 
 
 		 814 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  32.64 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  33.75 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  33.57 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  32.32 
 
 		 891 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  30.54 
 
 		 799 aa  77  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  31.43 
 
 		 522 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  34.51 
 
 		 808 aa  76.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  35.14 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  32.28 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  37.5 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1159  N-6 DNA methylase  30.36 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  36.09 
 
 		 822 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  34.75 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.82 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  33.77 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  30.46 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  30.95 
 
 		 827 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  30.54 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  35.34 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  32.19 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  31.88 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  29.61 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  31.08 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  30.91 
 
 		 809 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  29.65 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  26.96 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  26.92 
 
 		 511 aa  69.7  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  26.47 
 
 		 504 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  33.12 
 
 		 501 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  31.08 
 
 		 541 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  32.43 
 
 		 529 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>