More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0247 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  100 
 
 		 359 aa  712    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  74.44 
 
 		 356 aa  548  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  72.97 
 
 		 370 aa  541  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  61.54 
 
 		 355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  65.09 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  60.39 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  59.55 
 
 		 356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  55.01 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  56.45 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  54.44 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  58.86 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  57.18 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  49.57 
 
 		 358 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  48.28 
 
 		 348 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  47.41 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  52.74 
 
 		 348 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  47.56 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  51.51 
 
 		 349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  51.93 
 
 		 350 aa  324  1e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  44 
 
 		 340 aa  299  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.79 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  44.72 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  43.79 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  46.13 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  44.85 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  41.28 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  40.95 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  45.64 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  39.44 
 
 		 360 aa  247  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  37.5 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.5 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  44.29 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  39.05 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  34.43 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  41.67 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  42.25 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  36.81 
 
 		 374 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.9 
 
 		 347 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  39.88 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  41.87 
 
 		 301 aa  219  7e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  39.51 
 
 		 363 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  37.33 
 
 		 356 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  34.3 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  37.05 
 
 		 356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  37.8 
 
 		 355 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  39.81 
 
 		 361 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  36.06 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  40 
 
 		 360 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  36.54 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  37.62 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  37.12 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  37.98 
 
 		 357 aa  199  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.38 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  37.1 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  33.33 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  34.26 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.85 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  36.88 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  36.88 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  34.26 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  36.88 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.95 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  34.71 
 
 		 319 aa  189  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  32.39 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  33.14 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  29.43 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  36.22 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  33.73 
 
 		 365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  33.53 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  36.16 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  34.77 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  35.51 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  39.13 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  32.74 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  33.71 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  33.24 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  35.62 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1284  transport system permease protein  37.65 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.601831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  34.23 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  35.84 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  34.87 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  35.31 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  35.84 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  32.95 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  35 
 
 		 359 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.45 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  31.64 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  33.23 
 
 		 327 aa  176  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  34.69 
 
 		 359 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  35.8 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  34.69 
 
 		 359 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  31.74 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  34.86 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  32.49 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  35.2 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.47 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>