175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2906 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  73.48 
 
 
533 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  73.48 
 
 
508 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  81.91 
 
 
505 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  73.48 
 
 
508 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
505 aa  1008    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  65.95 
 
 
520 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  53.53 
 
 
520 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  48.03 
 
 
511 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  48.03 
 
 
511 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  48.03 
 
 
511 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  50.11 
 
 
495 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  47.31 
 
 
516 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  46.72 
 
 
521 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  43.72 
 
 
538 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  40.55 
 
 
525 aa  341  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  41.89 
 
 
506 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  36.16 
 
 
545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  40.61 
 
 
508 aa  283  7.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  39.13 
 
 
495 aa  280  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  37.18 
 
 
541 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  36.44 
 
 
524 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  38.4 
 
 
522 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  36.52 
 
 
500 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  39.47 
 
 
485 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  37.17 
 
 
537 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  39.03 
 
 
523 aa  266  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  34.22 
 
 
521 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  38.59 
 
 
521 aa  256  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  36.07 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  36.49 
 
 
542 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  32.84 
 
 
518 aa  249  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  36.51 
 
 
540 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  38.61 
 
 
527 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  37.53 
 
 
515 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  39.48 
 
 
515 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  37.39 
 
 
535 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  34.7 
 
 
551 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  34.51 
 
 
525 aa  226  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  36.69 
 
 
522 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  34.05 
 
 
546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  35.36 
 
 
518 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  33.77 
 
 
542 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  33.51 
 
 
564 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  28.42 
 
 
494 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  32.01 
 
 
530 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  34.15 
 
 
557 aa  199  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  29.31 
 
 
505 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  32.18 
 
 
643 aa  190  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  28.88 
 
 
504 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  31.36 
 
 
499 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  33.06 
 
 
535 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  29.94 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  32.81 
 
 
484 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  32.15 
 
 
542 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  32.47 
 
 
547 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.53 
 
 
546 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  32.12 
 
 
476 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  32.59 
 
 
521 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  30.57 
 
 
522 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  34.04 
 
 
505 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.13 
 
 
544 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  33.98 
 
 
571 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  27.27 
 
 
597 aa  159  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  30.59 
 
 
551 aa  157  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  29.57 
 
 
506 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.58 
 
 
478 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  29.21 
 
 
504 aa  153  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  29.62 
 
 
515 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  29.65 
 
 
520 aa  151  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  27.78 
 
 
532 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  29.57 
 
 
539 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.55 
 
 
532 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  34.87 
 
 
504 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  28.54 
 
 
508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  29.64 
 
 
518 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  38.67 
 
 
300 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  42.58 
 
 
527 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  29.86 
 
 
566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.49 
 
 
536 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  36.67 
 
 
597 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  30.59 
 
 
556 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  26.6 
 
 
613 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  33.33 
 
 
750 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
486 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 
555 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  34.16 
 
 
525 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  29.64 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  28.54 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  27.61 
 
 
499 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  27.82 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  28.14 
 
 
557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  35.19 
 
 
766 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  27.91 
 
 
542 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  29.2 
 
 
519 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  25.89 
 
 
475 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  28.17 
 
 
669 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  26.09 
 
 
546 aa  104  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  28.1 
 
 
533 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  31.86 
 
 
517 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  28.47 
 
 
535 aa  96.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>