221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1675 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
267 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  70.57 
 
 
264 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  61.22 
 
 
261 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  57.36 
 
 
310 aa  310  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  60.63 
 
 
261 aa  295  7e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  53.94 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  51.18 
 
 
253 aa  248  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
289 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5177  hypothetical protein  41.73 
 
 
266 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  hitchhiker  0.00169799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  39.1 
 
 
280 aa  161  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  36.05 
 
 
251 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 
271 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  30.49 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  30.08 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  24.31 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  24.31 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  24.06 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.88 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 
284 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  24.06 
 
 
284 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 
284 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  28.39 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  27.81 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  28.05 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  26.53 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
305 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  23.73 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  25.14 
 
 
311 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
198 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  24.6 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  31.58 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  26.8 
 
 
348 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 
348 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  28.73 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 
336 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  22.5 
 
 
250 aa  55.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.18 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  23.16 
 
 
324 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  27.9 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  27.32 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 
329 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 
344 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
279 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  28.69 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  30.05 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 
327 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  25.95 
 
 
315 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
279 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  28.49 
 
 
308 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 
310 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 
308 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 
308 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  27.23 
 
 
328 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 
313 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
284 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  24.08 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  26.5 
 
 
266 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  33.58 
 
 
322 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  28.36 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  21.43 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  31.93 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  29.79 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  23.88 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>