More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2388 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2388  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
522 aa  1059    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2069  extracellular solute-binding protein family 5  50.1 
 
 
518 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  47.62 
 
 
521 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  44.72 
 
 
500 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2017  extracellular solute-binding protein  39.42 
 
 
523 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0245155  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51940  extracellular solute-binding protein  42.51 
 
 
510 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0145  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.48 
 
 
521 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.5 
 
 
516 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
512 aa  210  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 
519 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.97 
 
 
545 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.71 
 
 
524 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 
518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.48 
 
 
524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.57 
 
 
524 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.57 
 
 
524 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.57 
 
 
524 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.57 
 
 
524 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.57 
 
 
524 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  27.57 
 
 
524 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
517 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  27.57 
 
 
524 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.38 
 
 
524 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.38 
 
 
524 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.01 
 
 
544 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.66 
 
 
523 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.89 
 
 
525 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
522 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  30.21 
 
 
502 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.15 
 
 
526 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.1 
 
 
520 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 
537 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.15 
 
 
526 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
512 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
512 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
512 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  26.18 
 
 
530 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.42 
 
 
511 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
555 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.62 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
530 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.24 
 
 
531 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  21.82 
 
 
575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25 
 
 
524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
516 aa  118  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
521 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.56 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.56 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  23.91 
 
 
538 aa  117  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
532 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
537 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.45 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  24.9 
 
 
538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
524 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.25 
 
 
525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  23.17 
 
 
527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.53 
 
 
520 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 
520 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 
575 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 
519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.12 
 
 
521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.74 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
510 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.7 
 
 
516 aa  114  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.7 
 
 
516 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.48 
 
 
511 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  23.19 
 
 
531 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
526 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
516 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  23.88 
 
 
554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  24.52 
 
 
526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  24.4 
 
 
532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  25.7 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1345  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.34 
 
 
552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.932628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 
495 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.1 
 
 
532 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  22.65 
 
 
533 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
517 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.11 
 
 
516 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 
525 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
519 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  24.6 
 
 
538 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.18 
 
 
528 aa  110  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
515 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.95 
 
 
516 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
532 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
518 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.03 
 
 
554 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.52 
 
 
513 aa  109  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 
575 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
509 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>