More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1453 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  98.3 
 
 		 294 aa  584  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  88.44 
 
 		 294 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1705  alpha/beta hydrolase fold  58.95 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  61.22 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  61.59 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 		 335 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  34.36 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  29.66 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  30.51 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  29.31 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  29.31 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  26.64 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  31.51 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  41.49 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 270 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  31.77 
 
 		 494 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  29.53 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.69 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  39.55 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  31.69 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  38.33 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 323 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 299 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  32.06 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  30.07 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  27.65 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>