191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2567 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  469  1e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  37.82 
 
 
213 aa  127  1e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  35.22 
 
 
228 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  32.1 
 
 
230 aa  120  2e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  32.1 
 
 
230 aa  120  2e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  36.13 
 
 
213 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  37.44 
 
 
228 aa  119  4e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  36.51 
 
 
229 aa  118  8e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  37.8 
 
 
228 aa  118  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  37.65 
 
 
240 aa  117  1e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  36.99 
 
 
240 aa  114  1e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  32.92 
 
 
229 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  35.65 
 
 
232 aa  109  4e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  33.07 
 
 
236 aa  108  7e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  35.29 
 
 
201 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  32.33 
 
 
261 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  34.19 
 
 
258 aa  104  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  36.76 
 
 
239 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  35.55 
 
 
248 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  37 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  34.42 
 
 
250 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  31.43 
 
 
244 aa  99  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  33.97 
 
 
207 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.67 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  33.19 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  34.6 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  30.3 
 
 
250 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  32.86 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  28.76 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  32.26 
 
 
242 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.5 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  32.69 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.66 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  32.87 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  32.19 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.5 
 
 
206 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  32.07 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  32.43 
 
 
206 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  32.35 
 
 
241 aa  89  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  36.59 
 
 
248 aa  88.2  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  32.84 
 
 
710 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  32.63 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  31.88 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  31.91 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.67 
 
 
207 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  32.07 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  4.0892e-05 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  31.84 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  30.8 
 
 
211 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  1.66827e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  31.47 
 
 
212 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  29.47 
 
 
207 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  32.06 
 
 
255 aa  85.1  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  28.45 
 
 
645 aa  84.3  1e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.83 
 
 
240 aa  83.6  2e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.9 
 
 
243 aa  83.2  3e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.36 
 
 
570 aa  83.2  3e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  29.92 
 
 
237 aa  83.6  3e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  24.35 
 
 
300 aa  82.8  4e-15  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  32.02 
 
 
207 aa  82.8  4e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  32.88 
 
 
243 aa  82.4  5e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  31.53 
 
 
207 aa  82.4  5e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  30.13 
 
 
237 aa  82.4  6e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  30.99 
 
 
447 aa  82  7e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  33.47 
 
 
209 aa  81.6  9e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  29.1 
 
 
652 aa  81.3  1e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  32.09 
 
 
449 aa  80.5  2e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  30.89 
 
 
578 aa  80.5  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  27.02 
 
 
284 aa  80.9  2e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  37.2 
 
 
238 aa  80.5  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  29.36 
 
 
204 aa  80.5  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  26.41 
 
 
281 aa  80.1  3e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  30.77 
 
 
452 aa  79.7  3e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  30.58 
 
 
234 aa  79.3  4e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  30.7 
 
 
997 aa  78.6  7e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  33.65 
 
 
193 aa  78.6  8e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  30 
 
 
283 aa  78.6  9e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  28.98 
 
 
453 aa  78.2  9e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  31.25 
 
 
237 aa  78.6  9e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  31.35 
 
 
235 aa  77.4  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  34.46 
 
 
215 aa  77.4  2e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.70273e-05 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  28.44 
 
 
670 aa  76.3  3e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.58 
 
 
661 aa  76.6  3e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  32.91 
 
 
274 aa  76.3  4e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  30.77 
 
 
257 aa  75.9  5e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  30.05 
 
 
454 aa  75.9  6e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  30.58 
 
 
689 aa  74.3  1e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  28.02 
 
 
562 aa  74.7  1e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.5 
 
 
236 aa  74.3  1e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.87 
 
 
693 aa  73.6  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  31.25 
 
 
708 aa  73.9  2e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  28.31 
 
 
724 aa  74.3  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  32.97 
 
 
243 aa  73.6  3e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  33.17 
 
 
212 aa  73.2  3e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  29.77 
 
 
230 aa  72.8  4e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.09958e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.32 
 
 
246 aa  72.8  5e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  28.04 
 
 
241 aa  72.4  5e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  28.63 
 
 
638 aa  72.4  6e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  29.31 
 
 
561 aa  72  7e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  28.14 
 
 
559 aa  72  7e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  26.16 
 
 
570 aa  71.2  1e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  31.35 
 
 
246 aa  70.5  2e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>