68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0474 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  63.78 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.93 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  33.03 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.2 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  27 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.91 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.51 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  29.44 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  30.25 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  24 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  30.05 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  27.49 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  26.48 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  22.46 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  22.46 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  23.64 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  22.77 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.12 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.96 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  28.79 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  24.5 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  25.53 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  29.95 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.33 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  23.27 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25.47 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  25.57 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  31.41 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  30.43 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  25.54 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  30.46 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  27.07 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.57 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  27.75 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  30 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.45 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.36 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  28.88 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  28.66 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  28.31 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.19 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  27.38 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  30.27 
 
 		 286 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  29.57 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.25 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  25.84 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  25.69 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.05 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  29.38 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.25 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.85 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  24.42 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  25.6 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4557  endonuclease IV  26.91 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  26.22 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  22.83 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.39 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2094  xylose isomerase domain-containing protein  31.43 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  29.6 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.78 
 
 		 325 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  24.67 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  24.29 
 
 		 304 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  21.28 
 
 		 247 aa  42  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.67 
 
 		 272 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  21.43 
 
 		 269 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>