More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0914 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  30.25 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
291 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  28.92 
 
 
291 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  27.71 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  28.21 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 
275 aa  89  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  29.44 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  30.24 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  28.18 
 
 
290 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  28.45 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.69 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  28.83 
 
 
280 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.91 
 
 
275 aa  85.1  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  29.7 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  30.99 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.54 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  29.7 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  27.62 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  28.33 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  28.33 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  28.81 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  28.81 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  28.81 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  28.97 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  28.81 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  28.91 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  26.85 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  28.91 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  28.91 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  25.75 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  27.24 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  26.12 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  29.86 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  26.47 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  27.47 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  27.35 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  36.88 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  29.13 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  29.13 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  29.13 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  27.85 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  29.13 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  33.57 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  33.57 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  27.54 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  24.6 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  30.3 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  28.5 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  28.5 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  26.78 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  26.22 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  28.25 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2269  putative dienelactone hydrolase  31.95 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  25.24 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  26.18 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  28.7 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.87 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  27.07 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  30.94 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  29.18 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  26.18 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  27.85 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  24.81 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  26.16 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  23.14 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  30.46 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  31.64 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.05 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.59 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  28.25 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>