71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1892 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  50 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50 
 
 		 273 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  43.82 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  41.58 
 
 		 280 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  28.36 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  23.81 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  24.91 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  24.91 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  24.91 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.16 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.08 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  23.45 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  25.37 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  25.61 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.72 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.14 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.14 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  25.59 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  26.91 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  27.59 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  20.21 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  27.94 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.94 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.61 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  22.61 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.5 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  26.53 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  28.49 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1928  hypothetical protein  25.77 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25.66 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  26.59 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  25.24 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  28.21 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  30.11 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  22.62 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  26.35 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  26.76 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  25.73 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.91 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  22.71 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.03 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  22.71 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.18 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  29.52 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  26.62 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  26.55 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  31.15 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.24 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.15 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  23.29 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.54 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  23.29 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  20.77 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  23.29 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.29 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  23.29 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  25.52 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.29 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  23.29 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  31.09 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  23.78 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  26.78 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.03 
 
 		 256 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>