More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2809 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  100 
 
 
609 aa  1255  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1728  long-chain-acyl-CoA synthetase  47.86 
 
 
612 aa  603  1e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  50.49 
 
 
608 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  51.16 
 
 
608 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  51.32 
 
 
608 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 
592 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.77 
 
 
592 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  41.07 
 
 
601 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.93 
 
 
592 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.77 
 
 
592 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.54 
 
 
600 aa  446  1e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.14 
 
 
597 aa  445  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
598 aa  441  1e-122  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 
603 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.36 
 
 
600 aa  401  1e-110  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.2 
 
 
596 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.18 
 
 
630 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.57 
 
 
608 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  5.71786e-05 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2309  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.7 
 
 
598 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.29 
 
 
622 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.6 
 
 
610 aa  365  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.3 
 
 
592 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.08 
 
 
605 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.02 
 
 
593 aa  358  1e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.08 
 
 
610 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1144  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.07 
 
 
590 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.036593  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  35.92 
 
 
621 aa  322  1e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  34.27 
 
 
639 aa  282  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78107  predicted protein  34.89 
 
 
653 aa  273  7e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06649  very-long-chain acyl-CoA synthetase family protein (CefD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03630)  30.84 
 
 
710 aa  266  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  31.27 
 
 
723 aa  261  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 
708 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 
572 aa  196  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.09 
 
 
534 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.09 
 
 
534 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.64 
 
 
545 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.31 
 
 
538 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 
552 aa  181  3e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 
512 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  29.37 
 
 
554 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  29.9 
 
 
557 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 
551 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 
551 aa  170  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 
544 aa  166  1e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 
522 aa  166  1e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  27.92 
 
 
500 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  27.92 
 
 
500 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  29.12 
 
 
501 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 
527 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.94 
 
 
550 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
549 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 
535 aa  160  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 
502 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  1.44188e-05 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 
539 aa  157  5e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.79 
 
 
517 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.41 
 
 
517 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  25.89 
 
 
547 aa  155  3e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.59 
 
 
535 aa  154  3e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.48 
 
 
517 aa  154  6e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.88 
 
 
517 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  27.95 
 
 
512 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.69 
 
 
517 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 
536 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1267  AMP-dependent synthetase and ligase  25.41 
 
 
981 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  27.98 
 
 
543 aa  147  7e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  26.74 
 
 
503 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 
533 aa  144  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3436  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 
586 aa  142  2e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0569509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 
539 aa  142  2e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 
518 aa  140  8e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 
613 aa  140  9e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 
542 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.18 
 
 
537 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 
517 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  29.76 
 
 
549 aa  137  6e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 
532 aa  137  6e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.05 
 
 
505 aa  137  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.08 
 
 
522 aa  136  1e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  25.79 
 
 
522 aa  135  2e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 
512 aa  135  2e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.79 
 
 
522 aa  135  2e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.39 
 
 
517 aa  135  2e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.47 
 
 
518 aa  135  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0039  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.88 
 
 
522 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.59 
 
 
517 aa  134  4e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.61 
 
 
509 aa  134  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.67 
 
 
516 aa  133  1e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.43 
 
 
503 aa  132  1e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0592  putative AMP-dependent synthetase and ligase  24.12 
 
 
543 aa  132  1e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29458  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 
521 aa  132  2e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  24.68 
 
 
535 aa  132  2e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 
501 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 
520 aa  130  5e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6181  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 
537 aa  130  7e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  23 
 
 
991 aa  130  8e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 
517 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  24.53 
 
 
495 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 
550 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11700  acyl-CoA synthetase  23.98 
 
 
999 aa  127  8e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.257643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1907  AMP-dependent synthetase and ligase  24.8 
 
 
543 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>