225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0721 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0721  permease  100 
 
 
302 aa  578  1e-164  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0299  permease  50.53 
 
 
286 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  25.9 
 
 
352 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.1 
 
 
356 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  24.04 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  26.01 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  23.72 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  25.18 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  23.68 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  23.08 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  23.16 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  21.96 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  23.1 
 
 
367 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  23.68 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  21.3 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  23.91 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  25.31 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  20.79 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  22.3 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  23.59 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  19.63 
 
 
402 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  22.26 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  26.39 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  21.74 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  28.68 
 
 
451 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  20.82 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  22.75 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  23.36 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  22.43 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  21.25 
 
 
347 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  22.35 
 
 
355 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  19.51 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  23.67 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  22.1 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  21.25 
 
 
337 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  22.02 
 
 
311 aa  62.4  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  19.64 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  19.7 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  22.1 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  20.13 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  23.14 
 
 
331 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  23.25 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  22.58 
 
 
382 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  21.74 
 
 
331 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  21.6 
 
 
350 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  21.74 
 
 
331 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  28.78 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  22.81 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  29.31 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  27.64 
 
 
475 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  19.22 
 
 
353 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  21.27 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  21.45 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  21.25 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  22.08 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  18.85 
 
 
330 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  21.45 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  21.45 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  21.45 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  21.25 
 
 
346 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  38.67 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  21.6 
 
 
345 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  21.45 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  37.33 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  21.43 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  21.37 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  25.87 
 
 
461 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  21.85 
 
 
389 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  21.85 
 
 
392 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  23.51 
 
 
343 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  22.13 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  20.85 
 
 
352 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  20.92 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  23.19 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  35.16 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  20.38 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  21.11 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  18.22 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  19.51 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  22.77 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  19.64 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  28.57 
 
 
362 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  18.4 
 
 
349 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  25.12 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  21.78 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  21.71 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  24.46 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  29.73 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  18.38 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  17.74 
 
 
381 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  30.86 
 
 
393 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  20.08 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  19.61 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  31.67 
 
 
357 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  19.34 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  18.28 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  23.29 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  27.52 
 
 
390 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  26.61 
 
 
461 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  20.08 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>