295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4814 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 279 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  82.35 
 
 		 264 aa  343  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  67.51 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  67.93 
 
 		 255 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  68.35 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  65.37 
 
 		 253 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  57.39 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  55.65 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  50.8 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  51.08 
 
 		 262 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  51.33 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  53.65 
 
 		 255 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  52.4 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  49.57 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  49.57 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  50.8 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  49.81 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  52.59 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  52.59 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  52.16 
 
 		 272 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  49.8 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  43.7 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  47.96 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  44.07 
 
 		 248 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  43.91 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  39.92 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  41.23 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.38 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  37.71 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  38.56 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  40.99 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.32 
 
 		 238 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  41.7 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  37.71 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.3 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.44 
 
 		 240 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  40.08 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  40.09 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  42.92 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.67 
 
 		 243 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  28.8 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.15 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  35.19 
 
 		 233 aa  112  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.4 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  32.05 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.63 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 231 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  33.19 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  34.03 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  38.96 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  30.7 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  36.57 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.27 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  34.47 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.48 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  27.9 
 
 		 220 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  35.14 
 
 		 233 aa  99.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.66 
 
 		 215 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  34.07 
 
 		 230 aa  99.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  29.57 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  40.22 
 
 		 222 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  38.1 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  35.87 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  35.62 
 
 		 239 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  27.9 
 
 		 239 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 247 aa  95.5  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  35.9 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  37.28 
 
 		 230 aa  95.5  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  28.89 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  34.81 
 
 		 231 aa  94  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  36.64 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  38.77 
 
 		 238 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  34.12 
 
 		 227 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  28.7 
 
 		 234 aa  92.8  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.97 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 		 214 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.39 
 
 		 245 aa  92  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>