More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0024 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
424 aa  833    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  50.24 
 
 
407 aa  333  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  51.3 
 
 
379 aa  330  4e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0107  trypsin-like serine protease  50.27 
 
 
425 aa  312  9e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  54.6 
 
 
419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2002  trypsin-like serine protease  50 
 
 
411 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.172847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2174  serine protease  44.11 
 
 
409 aa  288  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00156367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  48.47 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.72 
 
 
401 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  46.92 
 
 
406 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1818  2-alkenal reductase  39.95 
 
 
424 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5314  serine protease  44.38 
 
 
391 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1783  2-alkenal reductase  39.95 
 
 
424 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5710  serine protease  44.38 
 
 
391 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5567  serine protease  44.38 
 
 
391 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7078e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5610  serine protease  46.82 
 
 
381 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5158  serine protease  46.82 
 
 
391 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5645  serine protease  46.82 
 
 
391 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0281098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5142  serine protease  44.06 
 
 
391 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5254  2-alkenal reductase  46.15 
 
 
395 aa  249  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5351  serine protease  45.82 
 
 
391 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000264065  hitchhiker  6.04762e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2249  2-alkenal reductase  45.07 
 
 
411 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000589129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  43.42 
 
 
413 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3626  serine protease HtrA  43.21 
 
 
413 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000566135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5584  serine protease  45.82 
 
 
391 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1607  serine protease HtrA  41.25 
 
 
413 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000329826  hitchhiker  0.000000000234039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3619  serine protease  43.21 
 
 
413 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000616865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  42.66 
 
 
413 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  43.92 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3357  serine protease  42.66 
 
 
413 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000249985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  43.92 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  43.65 
 
 
413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  40.77 
 
 
413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4001  2-alkenal reductase  44.08 
 
 
393 aa  242  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  44.48 
 
 
396 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1808  trypsin-like serine protease  49.15 
 
 
285 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000335064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  41.37 
 
 
412 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.47 
 
 
435 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  37.62 
 
 
393 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1431  trypsin-like serine protease  44.11 
 
 
301 aa  209  8e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  36.03 
 
 
453 aa  209  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.4 
 
 
467 aa  207  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  41.16 
 
 
409 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.27 
 
 
400 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.58 
 
 
497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  38.7 
 
 
389 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  39.02 
 
 
412 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  34.25 
 
 
511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  43.93 
 
 
389 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.73 
 
 
496 aa  196  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  39.93 
 
 
368 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.25 
 
 
504 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  41.33 
 
 
528 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  38.51 
 
 
413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  38.89 
 
 
361 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.27 
 
 
501 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.27 
 
 
501 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.27 
 
 
497 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.67 
 
 
475 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.67 
 
 
475 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.67 
 
 
475 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.75 
 
 
387 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  40.34 
 
 
385 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  36.14 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  40.12 
 
 
502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.51 
 
 
376 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  40.36 
 
 
393 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  40.97 
 
 
481 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  38.87 
 
 
508 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.93 
 
 
482 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  39.93 
 
 
459 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.44 
 
 
502 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.44 
 
 
502 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.5 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.44 
 
 
502 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.44 
 
 
502 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  38.61 
 
 
469 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  38.44 
 
 
461 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.44 
 
 
485 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  41.14 
 
 
511 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.44 
 
 
502 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  38.68 
 
 
391 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40 
 
 
452 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.91 
 
 
417 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.78 
 
 
377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1081  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.59 
 
 
774 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.394549  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1103  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.59 
 
 
774 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00762901  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  39.31 
 
 
415 aa  180  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.8 
 
 
569 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  40.14 
 
 
442 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.49 
 
 
475 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  39.58 
 
 
515 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.36 
 
 
485 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  38.63 
 
 
387 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  38.83 
 
 
494 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  37.25 
 
 
502 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.33 
 
 
505 aa  177  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  36.96 
 
 
502 aa  177  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.18 
 
 
386 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.99 
 
 
490 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>