More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0391 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  55.12 
 
 		 753 aa  711    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  100 
 
 		 790 aa  1561    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  39.62 
 
 		 777 aa  475  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  38.33 
 
 		 750 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  36.79 
 
 		 767 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  36.95 
 
 		 920 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  36.38 
 
 		 852 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  36.95 
 
 		 930 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  36.88 
 
 		 933 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  36.88 
 
 		 945 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  36.88 
 
 		 728 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  36.18 
 
 		 804 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  35.94 
 
 		 803 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  35.75 
 
 		 796 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  35.94 
 
 		 803 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  36.27 
 
 		 798 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.5 
 
 		 727 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  36.36 
 
 		 714 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  35.94 
 
 		 803 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  37.25 
 
 		 745 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  35.62 
 
 		 813 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  35.75 
 
 		 728 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  35.59 
 
 		 733 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  35.37 
 
 		 751 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  34.96 
 
 		 728 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  36.03 
 
 		 728 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  33.56 
 
 		 734 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  32.66 
 
 		 737 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  32.3 
 
 		 739 aa  363  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  31.66 
 
 		 738 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  31.66 
 
 		 738 aa  362  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.89 
 
 		 728 aa  359  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  34.49 
 
 		 728 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  39 
 
 		 667 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  32.49 
 
 		 735 aa  352  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  30.45 
 
 		 737 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  30.87 
 
 		 736 aa  350  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  30.45 
 
 		 738 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  30.45 
 
 		 738 aa  350  8e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  31.1 
 
 		 737 aa  349  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  30.31 
 
 		 738 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.06 
 
 		 741 aa  347  6e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  31.89 
 
 		 738 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  30.89 
 
 		 751 aa  346  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  31.22 
 
 		 738 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.97 
 
 		 748 aa  341  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.45 
 
 		 754 aa  327  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  27.44 
 
 		 735 aa  312  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  31.89 
 
 		 729 aa  308  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  30.06 
 
 		 745 aa  299  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  30.01 
 
 		 764 aa  275  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  28.79 
 
 		 776 aa  269  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  28.06 
 
 		 771 aa  263  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  30.49 
 
 		 733 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  27.53 
 
 		 740 aa  212  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  32.44 
 
 		 720 aa  209  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.14 
 
 		 760 aa  204  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  41.24 
 
 		 707 aa  179  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.08 
 
 		 740 aa  172  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  33.9 
 
 		 746 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  36.39 
 
 		 333 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  36.39 
 
 		 320 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  36.39 
 
 		 320 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  39.29 
 
 		 981 aa  164  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  34.56 
 
 		 909 aa  163  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  36.2 
 
 		 311 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  36.59 
 
 		 900 aa  162  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.21 
 
 		 263 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  36.51 
 
 		 950 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.97 
 
 		 256 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  36.4 
 
 		 894 aa  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  36.49 
 
 		 923 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.62 
 
 		 263 aa  150  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.62 
 
 		 263 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.62 
 
 		 263 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.62 
 
 		 263 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.62 
 
 		 263 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.27 
 
 		 263 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.27 
 
 		 263 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.33 
 
 		 263 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.62 
 
 		 263 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.62 
 
 		 263 aa  149  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.56 
 
 		 320 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  33.68 
 
 		 259 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  33.11 
 
 		 275 aa  146  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  32.74 
 
 		 272 aa  145  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  33.43 
 
 		 345 aa  145  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  34.25 
 
 		 318 aa  144  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  34.44 
 
 		 273 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  35.94 
 
 		 253 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.78 
 
 		 275 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  35.19 
 
 		 318 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  31.49 
 
 		 260 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  33.22 
 
 		 275 aa  141  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.78 
 
 		 330 aa  140  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  35.05 
 
 		 875 aa  140  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.36 
 
 		 311 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  33.98 
 
 		 302 aa  138  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  29.79 
 
 		 775 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.87 
 
 		 319 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>