96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1758 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  100 
 
 		 350 aa  699    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  52.59 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  49.86 
 
 		 352 aa  342  5e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  42.2 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  39.2 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  38.92 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  38.64 
 
 		 348 aa  216  7e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  34.08 
 
 		 349 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  34.08 
 
 		 349 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  34.63 
 
 		 356 aa  215  8e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  31.4 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  30.62 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  30.06 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  30.45 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  30.45 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  30.53 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  30.53 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  29.01 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  25.14 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 		 368 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  25.76 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  24.15 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.17 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  22.83 
 
 		 375 aa  92.4  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.63 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  24.79 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  24.79 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  21.61 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  21.81 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  21.85 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  22.32 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  22.44 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  20.75 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  22.82 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  21.37 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.34 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  22.7 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  22.78 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  26.21 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  20 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  28.83 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  27.41 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  29.06 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  27.41 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.21 
 
 		 857 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  30.63 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  27.41 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  25.44 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  27.41 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  27.41 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  21.86 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  29.71 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  27.56 
 
 		 654 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  28.57 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  27.41 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  28.87 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  25.83 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  24.66 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  32.43 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.79 
 
 		 858 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  20.62 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  26.79 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  26.67 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  28.19 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  21.3 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  25.52 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  30.77 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  23.62 
 
 		 654 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  20.71 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 881 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  25.86 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10440  hypothetical protein  23.2 
 
 		 765 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.124596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  23.85 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  23.31 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  21.4 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  20.13 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  25.34 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 399 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  25.17 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  22.56 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  24.1 
 
 		 397 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  27.52 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  21.43 
 
 		 666 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  25.17 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>