More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0209 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  100 
 
 		 397 aa  810    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  64.25 
 
 		 400 aa  504  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  56.37 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  53.44 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 		 250 aa  239  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  44.54 
 
 		 424 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  42.48 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  47.5 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  43.35 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  45.34 
 
 		 254 aa  220  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  43.37 
 
 		 415 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  44.12 
 
 		 870 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  45.59 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  45.11 
 
 		 649 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  43.46 
 
 		 244 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  42 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  41.73 
 
 		 816 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  43.5 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  43.7 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  44.92 
 
 		 605 aa  216  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  43.31 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  41.98 
 
 		 439 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  40.86 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  44.96 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  42.75 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  36.47 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  42.41 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  40.96 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  38.97 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  50 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  45.11 
 
 		 410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 471 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 469 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 465 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 465 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 465 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 465 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 465 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  42.5 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  34.35 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.8 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  42.21 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  40 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  43.39 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  34.83 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  39.31 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  42.92 
 
 		 711 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  44.49 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 411 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  37.07 
 
 		 418 aa  209  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  40.34 
 
 		 418 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  40.85 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  34.85 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  49.04 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  41.76 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  41.22 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  43.46 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  48.51 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  41.06 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  41.47 
 
 		 420 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  34.97 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  50.25 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  37.87 
 
 		 455 aa  206  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  47.09 
 
 		 420 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  43.64 
 
 		 422 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  40.25 
 
 		 425 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  38.98 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  41.84 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  49 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  42.86 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  38.08 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  42.8 
 
 		 241 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  41.42 
 
 		 456 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  36.56 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  41.41 
 
 		 254 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  34.35 
 
 		 422 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  42.8 
 
 		 472 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  46.27 
 
 		 419 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  40.68 
 
 		 241 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  41.42 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  37.91 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  42.42 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  41.57 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  42.31 
 
 		 474 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  45.5 
 
 		 447 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  36.86 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  36.28 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  38.82 
 
 		 424 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  42.73 
 
 		 256 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  35.33 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>