213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 546 aa  1044    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  45.96 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  44.87 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  45.91 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  42.26 
 
 		 522 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  42.26 
 
 		 522 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  42.86 
 
 		 522 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  42.88 
 
 		 526 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  43.74 
 
 		 528 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  43.18 
 
 		 521 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  42.42 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  43.44 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  41.94 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  42.75 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  43.08 
 
 		 533 aa  368  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  42.38 
 
 		 522 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  43.5 
 
 		 521 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  43.9 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  43.9 
 
 		 522 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  43.9 
 
 		 522 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  43.9 
 
 		 522 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  43.75 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  43.39 
 
 		 526 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  41.15 
 
 		 520 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  40.08 
 
 		 527 aa  324  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  41.67 
 
 		 525 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  38.43 
 
 		 574 aa  316  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  41.62 
 
 		 529 aa  316  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  41.47 
 
 		 533 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  41.47 
 
 		 525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  37.24 
 
 		 525 aa  282  9e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  34.67 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  38.45 
 
 		 534 aa  279  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  36.98 
 
 		 532 aa  277  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.94 
 
 		 550 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  36 
 
 		 521 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  33.4 
 
 		 515 aa  256  8e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  35.41 
 
 		 517 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  35.63 
 
 		 504 aa  252  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.13 
 
 		 556 aa  250  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  34.92 
 
 		 510 aa  249  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  35.9 
 
 		 569 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  33.94 
 
 		 570 aa  241  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  34.53 
 
 		 552 aa  239  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  33.72 
 
 		 567 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  33.4 
 
 		 513 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.31 
 
 		 571 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  34.62 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.97 
 
 		 560 aa  229  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.31 
 
 		 564 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  36.63 
 
 		 561 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  37.05 
 
 		 629 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  33.47 
 
 		 507 aa  223  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  34.8 
 
 		 541 aa  220  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  33.2 
 
 		 557 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  35.52 
 
 		 587 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  31.37 
 
 		 493 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  31.44 
 
 		 577 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  31.44 
 
 		 577 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  32.43 
 
 		 567 aa  210  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  33.8 
 
 		 508 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  30.68 
 
 		 577 aa  205  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  31.4 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.48 
 
 		 638 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  32.43 
 
 		 497 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  32.43 
 
 		 497 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  31.61 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  31.98 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  31.1 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  32.53 
 
 		 451 aa  194  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  32.43 
 
 		 497 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  32.92 
 
 		 501 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  32.46 
 
 		 507 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  32.21 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.63 
 
 		 594 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  32.56 
 
 		 448 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  32.35 
 
 		 509 aa  188  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  31.62 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  28.92 
 
 		 779 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  32.61 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  32.56 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  31.31 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  32.03 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  32.03 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  32.03 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  32.03 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  32.03 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  31.22 
 
 		 448 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  30.4 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  31.1 
 
 		 460 aa  171  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  31.82 
 
 		 460 aa  170  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  31.79 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  31.96 
 
 		 460 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  31.96 
 
 		 460 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  31.96 
 
 		 460 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  30.2 
 
 		 459 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  27.94 
 
 		 466 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  31.14 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  23.95 
 
 		 470 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  26.98 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>