112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17460 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 470 aa  944    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12550  Na+/H+ antiporter  33.88 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.507606 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  35.36 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  35.36 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  35.36 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  35.36 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  35.36 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  34.57 
 
 		 460 aa  276  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  34.79 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  33.92 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  34.57 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  33.48 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  35.23 
 
 		 460 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  35.23 
 
 		 460 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  35.23 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  33.69 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  34.79 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  30.3 
 
 		 454 aa  237  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  31.09 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  27.08 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.25 
 
 		 550 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  25.76 
 
 		 574 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  26.8 
 
 		 561 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  25.96 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  26.69 
 
 		 517 aa  156  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25.29 
 
 		 564 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  26.63 
 
 		 522 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  27.84 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.31 
 
 		 560 aa  153  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  25.1 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  26.95 
 
 		 533 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  26.22 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  26.22 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  26.8 
 
 		 518 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  26.98 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  26.02 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  27.55 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  27.54 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  25.05 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  26.65 
 
 		 533 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.34 
 
 		 556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  26.28 
 
 		 521 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  26.4 
 
 		 528 aa  146  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  25.36 
 
 		 504 aa  146  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  26.85 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  27.54 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  26.19 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  24.71 
 
 		 525 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  26.85 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  26.34 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  27.42 
 
 		 521 aa  144  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  24.33 
 
 		 525 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  25.14 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  24.12 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  26.07 
 
 		 532 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  26.61 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  25.15 
 
 		 513 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  26.82 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  25.92 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  25.92 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  25.92 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  25 
 
 		 457 aa  136  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  25.46 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.65 
 
 		 638 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  27.46 
 
 		 629 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  25.24 
 
 		 569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.15 
 
 		 571 aa  133  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  24.72 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  23.96 
 
 		 571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  25.75 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.9 
 
 		 567 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  24.07 
 
 		 587 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  24.07 
 
 		 466 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  23.27 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.29 
 
 		 594 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  23.69 
 
 		 570 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  25.71 
 
 		 534 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.16 
 
 		 557 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  24.21 
 
 		 527 aa  113  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  22.78 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  22.84 
 
 		 577 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  23.03 
 
 		 577 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  22.54 
 
 		 577 aa  107  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  25.74 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  23.19 
 
 		 779 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  23.46 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  25.91 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  24.7 
 
 		 509 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01078  Na+/H+ antiporter  26.83 
 
 		 318 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  23.52 
 
 		 507 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  21.35 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  20.33 
 
 		 497 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  23.8 
 
 		 501 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  22.32 
 
 		 501 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  32.56 
 
 		 552 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  21.64 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  23.77 
 
 		 574 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  20.18 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  22.64 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  28.23 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>