232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2105 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
462 aa  885  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  70.57 
 
 
434 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.82 
 
 
450 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.59 
 
 
450 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  67.82 
 
 
441 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  71.76 
 
 
461 aa  538  1e-152  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  74.48 
 
 
463 aa  540  1e-152  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  71.76 
 
 
442 aa  528  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.2 
 
 
464 aa  516  1e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  64.85 
 
 
447 aa  516  1e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  61.83 
 
 
446 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  65.15 
 
 
434 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.78 
 
 
449 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  66.67 
 
 
437 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  65 
 
 
436 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  65.6 
 
 
436 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  67.21 
 
 
432 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.78 
 
 
461 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  63.51 
 
 
429 aa  471  1e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  62.23 
 
 
436 aa  468  1e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  57.89 
 
 
453 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  58.87 
 
 
451 aa  439  1e-122  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  50.9 
 
 
429 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  51.21 
 
 
414 aa  352  9e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  48.8 
 
 
422 aa  345  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  54.04 
 
 
539 aa  342  6e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  51.43 
 
 
442 aa  340  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  49.08 
 
 
433 aa  339  6e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  51.49 
 
 
408 aa  336  4e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  58.12 
 
 
431 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  52.52 
 
 
440 aa  327  4e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  49.62 
 
 
401 aa  313  3e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  50.38 
 
 
413 aa  304  2e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  53.61 
 
 
436 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  55.37 
 
 
447 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  1.7266e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  49.36 
 
 
390 aa  285  1e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  44.64 
 
 
402 aa  284  3e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.88 
 
 
404 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  39.08 
 
 
425 aa  243  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.59 
 
 
382 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.42 
 
 
391 aa  235  1e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  35.01 
 
 
394 aa  234  2e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  39.81 
 
 
455 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.85 
 
 
424 aa  233  4e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.53 
 
 
391 aa  233  4e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.61 
 
 
391 aa  233  4e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.24 
 
 
400 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.92 
 
 
391 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.43 
 
 
394 aa  233  7e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.44 
 
 
407 aa  233  7e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.64 
 
 
399 aa  232  8e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.69 
 
 
396 aa  232  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.36 
 
 
382 aa  232  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  38.93 
 
 
455 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.53 
 
 
397 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  40.82 
 
 
876 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.75 
 
 
397 aa  230  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  37.28 
 
 
383 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.26 
 
 
397 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.39 
 
 
391 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  39.86 
 
 
392 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.97 
 
 
409 aa  227  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.72 
 
 
392 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  36.75 
 
 
398 aa  226  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.72 
 
 
397 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  40.51 
 
 
391 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.97 
 
 
382 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.35639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.6 
 
 
389 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.98 
 
 
395 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  39.7 
 
 
393 aa  221  2e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  34.91 
 
 
391 aa  221  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 
389 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  35.03 
 
 
386 aa  220  4e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.18 
 
 
389 aa  220  4e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  39.36 
 
 
401 aa  220  4e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 
389 aa  220  4e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 
389 aa  220  4e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.69 
 
 
388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.69 
 
 
388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.69 
 
 
388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.69 
 
 
388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.69 
 
 
388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.41 
 
 
390 aa  219  8e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  35.48 
 
 
382 aa  219  8e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  35.48 
 
 
382 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  35.45 
 
 
438 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  9.33832e-11 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.1 
 
 
398 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  35.48 
 
 
382 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  35.1 
 
 
395 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.64 
 
 
389 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  36.07 
 
 
472 aa  216  6e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.38 
 
 
389 aa  216  1e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  34.89 
 
 
450 aa  215  1e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.29 
 
 
396 aa  215  2e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  36.5 
 
 
470 aa  214  2e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.76 
 
 
391 aa  214  2e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.56 
 
 
399 aa  214  2e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.12 
 
 
389 aa  214  2e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.75 
 
 
444 aa  214  3e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.59 
 
 
391 aa  214  3e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>