182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2527 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  72.97 
 
 		 227 aa  282  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  63.86 
 
 		 213 aa  254  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  63.68 
 
 		 212 aa  250  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 213 aa  224  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  56.57 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  55.02 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  54.04 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  56.67 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  59.14 
 
 		 199 aa  207  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 203 aa  191  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  49.25 
 
 		 205 aa  174  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  50 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  48.5 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  53.71 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  49.44 
 
 		 180 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  49.72 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  48.04 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  43.75 
 
 		 252 aa  144  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  45.56 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  30.17 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  27.49 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  26.9 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  26.32 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  25.73 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  25.73 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  25.73 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  25.73 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  25.73 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  38.04 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  39.08 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  39.47 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  31.55 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 159 aa  52  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  27.71 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  26.51 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 277 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 155 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  25.14 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  29.34 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  27.68 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  26.17 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  32.61 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 111 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  28.31 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  48 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 121 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  24 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  33.94 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  32.93 
 
 		 271 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  44 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  26.32 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  22.87 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  40.74 
 
 		 109 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  31.4 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  28.74 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 109 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 125 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 121 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 107 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  34.02 
 
 		 109 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 123 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  24.43 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 168 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  29.13 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 174 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  24.57 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>